La sezione di studio nasce nel 1998 con lo scopo di approfondire gli argomenti correlati al concetto di salute e malattia nel medioevo, alle teorie e tecniche della medicina e della chirurgia e all'analisi dei testi medici del medioevo e del primo Rinascimento.

Promosso da Fabio Cavalli e Roberto Gagliardi attraverso il "Progetto Avicenna" che mirava a raccogliere e tradurre i testi di medicina del XIII secolo è continuata. dopo la scomparsa di Roberto Gagliardi, attraverso l'organizzazione di studi, seminari, articoli e conferenze sul tema. 

Successivamente, per iniziativa di Paolo Ghiara, si è aggiunta una sezione dedicata alla storia della Farmacia.

Nel 2005 la sezione di studio ha aggiunto ai suoi interessi la Paleopatologia e la Bioarcheologia, con particolare interesse per il periodo tardo-antico e medievale, attraverso l'allestimento di un Laboratorio di Osteoarcheologia nella sede dell'Accademia e la creazione di una rete di strutture simili  anche a livello internazionale.